A la recherche de moyens de lutte

Le feu bactérien est une maladie bactérienne hautement infectieuse, qui peut provoquer des pertes de rendements considérables dans les vergers de fruits à pépins. La lutte contre cette maladie et son agent pathogène Erwinia amylovora est difficile. Diverses nouvelles stratégies de lutte ont été exposées lors de la conférence nationale sur le feu bactérien qui s’est tenue en novembre 2018 à Agroscope Wädenswil. Certaines méthodes se trouvent en phase de test en laboratoire et ne sont pas encore utilisables dans la pratique. La lutte est complexe et, comme l’a relevé Alain Gaume, d’Agroscope : « différents outils sont nécessaires afin de disposer d’une solution intégrée contre le feu bactérien ». La recherche y travaille d’ar-rache-pied.

Stratégies de protection des plantes

Le centre des fruits à noyau de Breitenhof, à Wintersingen ( BL ), comprend une parcelle d’essai sur laquelle des tests sur le feu bactérien sont effectués dans des conditions proches de la pratique. Les essais s’accompagnent de normes de biosécurité sévères. La parcelle est ainsi entièrement recouverte de filets et n’est accessible que par un sas. Les tests portent principalement sur la sensibilité variétale et les stratégies d’application de produits phytosanitaires. Anita Schöneberg et Vanessa Reininger, collaboratrices scientifiques à Agroscope, ont testé l’efficacité de deux produits : LMA et Blossom Protect. Le LMA contient du sulfate de potassium-aluminium, le Blossom Protect se compose de levure et est autorisé en agriculture biologique. Tous deux ont été appliqués sur des pommes Gala Galaxy et Ladina et ont eu globalement la même efficacité. La comparaison des deux variétés de pommes a confirmé que Ladina est une variété robuste ; elle a été moins touchée par le feu bactérien que Gala Galaxy. De plus, les deux produits phytosanitaires ont présenté une efficacité supérieure sur Ladina que sur Gala Galaxy. Selon Agroscope, c’est en combinant la culture de variétés robustes et une stratégie phytosanitaire adéquate que l’on peut le mieux combattre le feu bactérien.

Modèle de prévision Maryblyt

Le modèle de prévision Maryblyt calcule, pour différentes régions de Suisse, le risque d’infection par le feu bactérien durant la période de floraison sur la base de la température et de l’humidité. Dans ses essais, Vanessa Reininger a évalué dans quelle mesure les prévisions du modèle correspondent aux attaques réels de feu bactérien. Pour cela, le nombre de cellules de la bactérie pathogène Erwinia amylovora a été déterminé dans les fleurs de pommier, puis comparé au potentiel d’infection calculé par le modèle. Il s’est avéré que lorsque la densité de cellules était élevée, la prolifération cellulaire ne coïncidait pas toujours avec le modèle. Il faut toutefois relever que, dans la pratique, la densité de cellules est généralement plus faible que dans les parcelles expérimentales, où la pression d’infection est maintenue artificiellement à un niveau élevé. Une telle situation ne devrait pas survenir dans la pratique. Vanessa Reininger recommande toutefois de garder un œil sur une éventuelle attaque même lorsque le potentiel d’infection est évalué comme faible.

Variétés robustes

Avec son équipe, Martin Kellerhals d’Agroscope développe des variétés de pommes résistantes au feu bactérien. Des gènes de résistance provenant de pommes sauvages et de variétés robustes sont introduits par sélection classique dans de nouvelles variétés de pommes. La résistance au feu bactérien de ces variétés potentielles est testée aussi bien sous serre qu’en plein air. La méthode Fast Track a été testée afin de développer plus rapidement de nouvelles variétés de pommes. Avec cette méthode, des conditions hivernales sont simulées sous serre. Il est ainsi possible d’accélérer le cycle des générations et de tester plus rapidement la résistance au feu bactérien de nouveaux croisements.

A Agroscope, Andrea Patocchi travaille aussi dans le domaine des variétés robustes au feu bactérien. Il teste notamment des nouvelles technologies de sélection et analyse les avantages et les risques des nouvelles variétés à l’aide de la cisgénétique. L’Office fédéral de l’agriculture a autorisé un essai en plein champ sur le « protected site », un site d’essai protégé, pour étudier une lignée de Gala cisgénique résistante au feu bactérien.

Lutter avec des bactéries…

Cosima Pelludat étudie l’efficacité d’antagonistes bactériens. La chercheuse a prélevé pour cela des échantillons de pommiers sur le site de Wädenswil et a analysé quels mi-cro-organismes se trouvent dans les fleurs de pommier. Il s’est avéré que seul un petit nombre d’espèces dominait, comme Erwinia tasmaniensis. Cette bactérie est apparentée à Erwinia amylovora, responsable du feu bactérien, mais elle ne provoque pas cette maladie. L’objectif consiste à trouver un antagoniste indigène qui occupe la fleur afin de prendre la place de l’agent pathogène du feu bactérien.

…ou des virus

La Haute école zurichoise des sciences appliquées ( ZHAW ) suit aussi une nouvelle approche dans la lutte contre le feu bactérien. On y étudie la possibilité d’utiliser des virus. Certains de ces bactériophages attaquent la bactérie responsable du feu bactérien et la neutralisent. Les bactériophages n’ont aucun effet nocif sur l’environnement, ils sont capables d’autoreproduction et d’autolimitation, ce qui signifie qu’ils disparaissent une fois toutes les bactéries du feu bactérien disparues, explique la chercheuse Leandra Knecht. Les bactériophages sont spécifiques à un hôte. Il est donc possible de les utiliser de manière ciblée contre Erwinia amylovora, comme le montrent les bons résultats obtenus en laboratoire. La ZHAW teste un cocktail de différents bactériophages pour obtenir une efficacité optimale. Des travaux de recherche supplémentaires sont encore nécessaire afin d’évaluer l’utilité des bactériophages dans la pratique. Ces organismes peuvent aussi servir de test de détection pour le feu bactérien. Les recherches suivent leur cours.